西厂在明朝历史上只短期存在过，明宪宗成化年间成立了一个新的内廷机构西厂。其势力甚至超过了老前辈东厂。
不过西厂仅仅成立5个月就被撤销，只相隔一个月宪宗又恢复西厂。明武宗继位后，大太监刘瑾掌权，宦官势力再度兴起，西厂复开。刘瑾倒台，武宗才下令撤销西厂。西厂作为一个临时产品，就这样在历史上永远地消失了。
锦衣卫的首领称为指挥使或指挥同知、指挥佥事，一般由皇帝的亲信武将担任，很少由太监担任，属于外臣。而东厂的首领是宦官，即内臣。
在与锦衣卫的关系上，东厂后来居上。由于东厂厂主与皇帝的关系密切，又身处皇宫大内，更容易得到皇帝的信任。锦衣卫向皇帝报告要具疏上奏，东厂可口头直达；皇帝还赋予东厂督主以监督锦衣卫人员的权力。所以东厂和锦衣卫的关系，逐渐由平级变成了上下级关系。
在宦官权倾朝野的年代，锦衣卫指挥使见了东厂厂主要下跪叩头。
田尔耕、许显纯、孙云鹤、杨寰和崔应元等人虽然没有料到两位东厂大太监，这么快就到了，意外之余，还是第一时间上前跪拜
“参见李公公，参见石公公。”田尔耕、许显纯、孙云鹤、杨寰和崔应元等一众锦衣卫大员，一起在李永贞和石元雅坐轿前行礼，神态恭敬，不敢有半点马虎。
“不必弄这些虚礼，都起身吧。”李永贞细声细气的回应了一声，然后问道“这大半夜的，怎么出了这么大的事情到底是怎么回事你们都说说看。”
田尔耕紧张的满头大汗，支支吾吾的说不出个所以然来，好容易憋出一句“歹徒暂且不明，我们正在抓紧追查这帮顺天府衙役实在无用，这条街的几十名衙役此前全部失踪他们一点线索都没有。”
先将锅子盖在顺天府的头上，再表示自己的锦衣卫正在努力这是很常规的推卸责任手段。
李永贞与石元雅对视了一眼之后，李永贞轻轻地哼了一声，细声细气的问石元雅“石公公，你说怎么办”
“先封闭城门，稽查元凶吧这大晚上的作案，料来人还内城”石元雅道“要么就报与九千岁拿主意或者是让内阁拿个主意”
李永贞听了石元雅八面玲珑的意见，笑道“你这一句话，说出来了三个主意，这不等于没说吗凶手在不在内城，都不能随意封闭城门，这得有九千岁，或者首辅直接下令才成。现在叶向高刚刚去职，首辅空缺，至少要到年关才能立出新的首辅，问内阁那帮只会拿朝廷俸禄，只会吵架说大话的人，是问不出什么名堂的。”
石元雅和一群锦衣卫大员都不懂李永贞具体要说什么，却急忙点头称是，都说督公高见。
李永贞还是有些大能力敢任事，敢为魏忠贤分担压力，敢于直接拿出意见，当即批示道“锦衣卫，东厂，顺天府立即查明凶手是哪些人为什么火烧京师店铺不管明察暗访，怎么去查，不要影响京师正常出入，不要造成人心惶惶。田尔耕，你们几个都是九千岁信得过的人，这事情，你挑头吧对了，只是烧了店铺，有抢到财物吗有没有听说金银或者古玩珍宝被盗”
田尔耕并不比李永贞和石元雅早到多久，看向身边的几个人。
许显纯与田尔耕关系不错，知道旁人不敢开口，是怕田大人嫉恨抢他风头，遂代田尔耕答道“回督公的话，暂时没有听说
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