派遣吴汉率领王梁等九位将军。
于邺城东面的漳水河畔大败檀乡贼，十余万人全部投降。
吴汉又率领诸将攻击邺西山贼黎伯卿等人，追到了河内修武，攻破贼兵所有屯聚。刘秀亲自赶来抚问慰劳诸将与军队。
刘秀又复遣吴汉进兵南阳郡，攻破宛、涅阳、郦、穰新野各城，引兵南下，与秦丰战于黄邮水上，大破敌军。
吴汉御下不严，汉兵所过之处，多有侵暴行为。
破虏将军邓奉请求回新野省亲，他见到吴汉掠夺他的家乡，十分愤怒。
于是叛变，击溃吴汉的军队，屯聚淯阳，与董等人联合。
直到第二年夏天，汉军才得以击破叛军。
吴汉与偏将军冯异攻击昌城五楼贼张文等人，又进攻铜马、五幡，全部都取得了胜利。
汉光武帝建武三年春，吴汉率领耿弇、盖延进攻并且降服了轵县地区的青犊军。
而后，吴汉又率领杜茂、陈俊等南下攻打梁王刘永，将其大将苏茂围困在广乐，刘永将领周建招聚收集得十余万人，救援广乐。
吴汉率领轻骑迎与之战，作战不利，从马上坠落下来伤了膝部，只得回营，周建于是带兵进城。
诸将认为主将受伤休战，属下们会感到惶恐害怕。
于是吴汉就裹好膝部创伤而起，杀牛使士卒们饱餐，激励士卒，于是军心大振。
第二日，吴汉率精兵突骑，一齐鼓噪而进。
周建军大溃，反身奔回城中。
吴汉长驱追击，大破敌军。
破城后，吴汉留杜茂、陈俊等守广乐，自己率领大军协助盖延围刘永于睢阳。
七月，睢阳城中食尽，刘永被部将所杀，二城全部投降。
建武四年，此时，吴汉又率领陈俊和王梁前将军，击溃临平的五校贼。
追杀至东郡箕山，大败敌军。又北上平定清河长直和平原五里的贼寇。
当时鬲县五姓联合驱逐了县令，占据城池反叛。
诸将都想进攻，吴汉不同意，认为罪在魁首，于是上书告知郡守，让他们逮捕县令，并派人向城内表示感激。
五姓大喜，纷纷率众投降。
诸将都佩服吴汉不费一兵一卒就使全城投降。
冬天，吴汉率领建威大将军耿弇、汉忠将军王常等，击破并降服了平原的富平、获索。
汉光武帝建武五年贼军趁夜偷袭汉军营寨，军中一片混乱，吴汉却镇定自若，不久就恢复了秩序。
他随即带领精兵突出营寨，发动突然袭击，大败敌军。
他继续追击剩余的贼党，一直打到无盐县，又平定了勃海。
汉光武帝建武六年，吴汉随刘秀围困并攻破朐城，斩杀董宪。山东自此完全平定。
汉光武帝建武六年，关东平定以后，陇右的隗嚣复叛，刘秀命吴汉率军镇守长安。
建武八年，吴汉随刘秀西征隗嚣，与岑彭合力围困隗嚣于西城，又调集关中诸郡的兵马增援。
“刘秀东归时，嘱咐吴汉应尽快遣散多余部队，若有逃散必使士气低落。”
“吴汉与诸将因自恃兵多势强，不愿放弃诸郡兵的辅助，遂不从命。”
“后来果然粮食不足，士卒逃亡。”
“十一月，岑彭壅谷水灌西城，水还没淹没城池一丈高，隗嚣将领行巡、周宗就已带着蜀地公孙述的援军前来。”
““于是
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