中庶子、兖州大中正。
元熙二年六月丁卯日，刘裕称帝，改国号为宋，是为宋武帝，降封司马德文为零陵王，东晋灭亡，改元永初。
檀道济被封为护军将军，加散骑常侍，主管石头城防务，准许不用通传即可进入宫廷。
又因其有辅佐开国之功，封为永修县公，食邑二千户，位列丹阳尹。
其后檀道济又出任为镇北将军、南兖州刺史，镇守广陵，监管淮南各路军队。
永初三年，宋武帝刘裕身体不适，护军将军檀道济同长沙王刘道怜、司空徐羡之、尚书仆射傅亮、领军将军谢晦一起进宫侍奉刘裕就医吃药。
不久，刘裕病重，赐予檀道济可带宝剑披甲胄的护卫军士二十人。
并遗命司空徐羡之、尚书仆射傅亮、领军将军谢晦及护军将军檀道济四人为顾命大臣辅佐太子刘义符。
景平元年，刘义符登基，是为宋少帝，而北魏乘宋武帝新丧之际，发兵南进，攻略宋地。
于东阳城包围了青州刺史竺夔，刘义符下诏加封檀道济为使持节、监征讨诸军事，率军前往东阳驰援。
但还未等檀道济军队到达，北魏军队已烧掉营房、焚毁攻城器具逃走。
檀道济本要出城追击，却因城内无粮，只得打开粮窖取出陈年之谷以充军粮。
然而粮窖深达数丈，等到将稻谷碾成米，已经过去了一夜，北魏兵早已逃远，无法再追。
檀道济只能作罢。之后，檀道济回师镇守广陵。
刘义符登基后，在为其父守丧期间，行为举止违反礼仪，喜欢与左右侍从嬉戏游乐，没有节制，令朝臣大失所望。
“景平二年，司空徐羡之等人密谋废黜少帝刘义符，而依次立为帝的人是刘裕次子庐陵王刘义真。”
“但刘义真性格轻浮不稳，与徐羡之等人不合，于是徐羡之等人决定先废刘义真为庶人。”
“并告诉了檀道济，檀道济提出异议，屡次劝阻徐羡之，均不被采纳。”
“之后，徐羡之等人以国讣为托辞让檀道济入宫守卫朝堂，等其到建康后，徐羡之才把废立皇帝的密谋告诉他。”
“在准备废黜少帝的前一晚，檀道济进入领军府跟谢晦同宿，谢晦整晚惊恐不安，难以入睡，而檀道济却倒头即入梦乡，谢晦对此非常佩服。”
“当时刘义符在龙舟上游玩入寝，天亮后，檀道济等人带兵杀入，杀死少帝身边的两名侍从。”
“将酣睡中的刘义符带到岸上，收取其印玺，群臣拜辞后，送于东宫，后以张太后的名义废其为营阳王。”
“不久，徐羡之、檀道济等人拥立刘裕三子刘义隆为帝，是为宋文帝。”
“文帝登基后，加封檀道济为征北将军，散骑常侍，并进封武陵郡公，食邑四千户。”
“但檀道济辞谢进封，文帝又增派其主管青州、徐州之淮阳、下邳、琅琊、东莞五郡诸军事。”
“后来，文帝以杀害宜阳王刘义符、庐陵王刘义真之罪处死徐羡之等人，并派檀道济平定谢晦叛乱。”
“檀道济在隐矶大败谢晦，于延头将其收押送回都城，檀道济被升为征南大将军、开府仪同之司、江州刺史。”
“监管江州、荆州的江夏、豫州西阳、新蔡、晋熙四郡诸军事，并增封千户。”
“元嘉八年，宋文帝任命到彦之为主将率军北伐北魏，
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