，一直被储存在肖母巢内部的根源之涡，也像是感受到了某种召唤似的，在肖源源不断的孕育之下，悄然发生着变化，最终竟蜕变成了一颗崭新的 s2 机关！
紧接着，这颗全新的 s2 机关毫不犹豫地没入了初号神的身体内部……
此时此刻，补完计划与初号神的体内拉开帷幕，但这一次参与融合的对象却不再是那些人类；取而代之的，乃是经过无数次生死轮回后凝聚而成的根源之涡！
说得更直白一些，肖实际上是将淀真嗣先前储存起来的力量夺为己有了。
事实上，所谓的“根源之涡”，正是那曾令整个世界都陷入无穷无尽轮回当中的碇真嗣的神之本体！
每当一轮回结束，每次完成补完之后，心有不甘的淀真嗣总会因为种种缘由而变得愈发偏执狂躁，进而选择重新启动轮回程序，
每次轮回后，碇真嗣都会沦为凡俗之人继续进行下一次的补完。
如此周而复始，年复一年，日复一日，他的神力也在这般漫长岁月里一点一滴地汇聚沉淀，
最终又被他全部抛弃，进而演化成了能够贯通世间万物，连接无数因果的恐怖存在——根源之涡！
也正因如此，加夫之门才得以诞生，事实上加夫之门这东西在最初之时根本不存在，是后续随着时间线的轮回不断叠加因果才出现的特殊规则之物。
人类补完竟然在逆转……这怎么可能！?
nerv岛国分部总司令，碇真嗣的父亲，碇源堂瞪大双眼，满脸惊愕地望着那遮天蔽日、覆盖全球的巨大光翼，整个人的精神都有些崩溃。
在那片耀眼光芒之中，所有曾经被聚合成为半成品试图的存在都瞬间化为了普通人类。
这个结果完全超出了碇源堂的预料，他精心策划长达数万年之久的计划就这样功亏一篑，如此沉重的打击令他几乎无法承受。
然而就在下一刻，他却突然变得平静下来，仿佛一切都已释然，甚至连嘴角都忍不住上扬。
原来，随着人类补完计划被逆转，所有的 eva 和使徒也一同被瓦解消散。
那些先前被 eva 吞噬的灵魂终于重获自由，再度降临世间，并被神给予了全新的身躯，得以复活。
其中最为引人注目的当属初号机，它在被光翼吸纳之后，将碇源堂朝思暮想了数万载岁月的妻子：碇唯竟抱着碇真嗣从新出现了众人面前。
不仅如此，曾遭使徒毒手的明日香，还有被二号机吞噬掉的明日香的母亲——惣流·恭子·齐柏林，亦相继随着使徒和 eva 的消逝而重现于世。
而她们的复生知识一个开始，在eva消融之后，一切的起源，使徒的最初两位始祖：亚当与莉莉丝，也随之消散。
刹那间，一片翠绿欲滴、洋溢着勃勃生机的光雨，它们如轻纱般轻柔地飘洒而下，滋润着这颗饱经沧桑的星球。
原本弥漫于天地之间的猩红血色迅速褪去，取而代之的是肉眼可见的植物从大地之下生长出来。
如果站在天空之上俯瞰下去，便会惊奇地发现，那颗原本被鲜血染成猩红一片的地球，此刻正以惊人的速度焕发出勃勃生机。
它就像是一个沉睡许久后刚刚苏醒过来的巨人，慢慢地舒展着身躯，展现出那令人叹为观止的生命力和活力。
随着时间的推移，地球表面开始呈现出蓝、绿、黄三
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